富士急行は、2017年3月4日（土）のダイヤ改正にあわせ、JR直通列車における富士急行線内の特急料金、座席指定料金、グリーン料金を設定する。対象となる列車は、成田エクスプレス、ホリデー快速富士山号など。
成田エクスプレスは、土日祝日を中心に1往復が富士急行線に乗り入れている。現在は富士急行線内のみの乗車の場合、普通車では料金が不要だが、3月4日からは新たに特急料金を設定する。新設される特急料金は、富士急行線内を走るフジサン特急、富士山ビュー特急と同額で、大月～都留文科大学前間などが200円、大月～河口湖間などが400円。このほか、グリーン料金も新たに設定する。富士急行線内でのグリーン料金は一律600円。
また、ホリデー快速などの座席指定料金も設定する。富士急行線内での料金は200円で、JR線と通算した場合は720円となる。
新たな料金設定は、2017年3月4日のダイヤ改正日に実施。なお、富士急行線内のみ乗車の場合、座席指定やグリーン車への乗車はできない。
