しなの鉄道、えちごトキめき鉄道、あいの風とやま鉄道、IRいしかわ鉄道の4社は27日、国土交通省北陸信越運輸局に対し、上限運賃の認可申請を行った。4社は、2015年3月14日（土）の北陸新幹線金沢開業に伴って並行在来線の運営を行う第三セクター会社。
各社が申請した上限運賃の初乗り額は、しなの鉄道（北しなの線）が190円、えちごトキめき鉄道が140円、あいの風とやま鉄道が190円、IRいしかわ鉄道が170円。えちごトキめき鉄道は現行のJR運賃と同水準にした一方で、ほかの3社は現行のJR運賃よりも高い水準で設定した。しなの鉄道は、現行のしなの鉄道線（軽井沢～篠ノ井間）と同じ水準。あいの風とやま鉄道は、今回認可申請した上限運賃より安い運賃を別途設定する予定で、開業時の初乗り運賃は160円となる。
あわせて4社は、予定している乗継割引運賃について明らかにした。各社とも他社線との境界駅の前後約10キロの範囲で、またがる2社両方の割引を行うほか、境界から10キロを超える範囲でも、どちらか1社が割引を実施し、現在のJR運賃からの負担増を少なくする。通学定期ではさらに割引率を高くする予定。なお、しなの鉄道とえちごトキめき鉄道におけるJRとの乗継割引については、開業後5年間が限度になる。
乗継割引の適用により、2社にまたがるものの、現行のJR運賃より安くなる区間もある。例えば、北しなの線とJR飯山線にまたがる長野～飯山間では、普通運賃が現行580円に対し来春以降は530円、通勤定期が現行1万7240円に対して1万7180円と、わずかに安くなる。ただし、同区間の通学定期については、しなの鉄道の通学定期券の割引率がJRより低いため、現行の7780円に対して今後は1万2610円になり、逆に6割以上も値上がりする。
